En Kyoto no Neko, de 2 a 4 jugadores son pequeños gatos que exploran la ciudad moderna de Kyoto, Japón. Estos podrán viajar través de una serie de historietas independientes y rejugables.
En cada historieta, los jugadores deberán completar varias misiones que conforman la vida de un gato: desde hacerse amigo de un estudiante hasta luchar contra un gato callejero agresivo o, incluso, robar la comida del platito de otro jugador. Durante cada partida, cada gato evolucionará, desarrollando sus habilidades y adquiriendo la capacidad de explorar nuevas partes del mapa trepando arbustos y tejados.
Mediante un sistema de habilidades, en Kyoto no Neko, cada jugador interactuará con la variada población que conforma la ciudad de Kyoto, tanto animales como humanos. Cada turno brinda la oportunidad de descubrir algo nuevo sobre la ciudad, ya que los jugadores revelarán elementos, desde pequeños insectos hasta conocidos aspectos de la ciudad.